160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0884 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  972    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  91.78 
 
 		 499 aa  874    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  91.35 
 
 		 499 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  65.59 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  38.34 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  34.17 
 
 		 532 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.77 
 
 		 529 aa  312  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.07 
 
 		 517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  38.85 
 
 		 517 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  33.72 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.06 
 
 		 517 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  31.87 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  34.91 
 
 		 531 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  35.28 
 
 		 506 aa  282  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  34.91 
 
 		 531 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.86 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  34.48 
 
 		 545 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  33.1 
 
 		 520 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.87 
 
 		 489 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.25 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.71 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.94 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.9 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.12 
 
 		 484 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  23.16 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  24.89 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  21.19 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  20 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  26.38 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  26.93 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.11 
 
 		 440 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.26 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.58 
 
 		 492 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  25.89 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.12 
 
 		 457 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  25.11 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  21.01 
 
 		 475 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  24.82 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.67 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.67 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  24.5 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  24.16 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  21.81 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  26.24 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  25.71 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  24.92 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  21.25 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  21.5 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.09 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.52 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.3 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  25.96 
 
 		 461 aa  57  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  30.12 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  25.85 
 
 		 462 aa  55.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  28.07 
 
 		 451 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  28.07 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  24.64 
 
 		 454 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  29.55 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  24 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.55 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  26 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 297 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  29.8 
 
 		 303 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.55 
 
 		 460 aa  50.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 307 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  27.66 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  25.18 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  25.18 
 
 		 449 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  29.28 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  26.62 
 
 		 307 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  32.2 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  26.63 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  27.15 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  28.21 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  34.19 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  31.45 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  28.07 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  28.69 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 184 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  26.23 
 
 		 308 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05910  Ferrous iron transport protein FeoB  33.85 
 
 		 173 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564086  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  31.93 
 
 		 625 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  25.16 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  29.1 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  28.17 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  23.5 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  29.71 
 
 		 184 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  28.93 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  29.95 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  30.97 
 
 		 301 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  28.87 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  23.71 
 
 		 298 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  30.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  27.27 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  26.97 
 
 		 455 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  23.67 
 
 		 310 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>