36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  887    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  53.65 
 
 
452 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  50.71 
 
 
451 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  50.47 
 
 
451 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  53.06 
 
 
409 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1041  hypothetical protein  54.03 
 
 
427 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06261  hypothetical protein  35.98 
 
 
444 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06561  hypothetical protein  35.98 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0600  hypothetical protein  35.61 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06651  hypothetical protein  35.21 
 
 
441 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  34.44 
 
 
459 aa  97.8  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  22.63 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  26.61 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  28.2 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  35.43 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  27.84 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.9 
 
 
517 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  30.28 
 
 
545 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  32.62 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  27.87 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  25.35 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  31.43 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.53 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  25.46 
 
 
475 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  36.61 
 
 
529 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  34.82 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.09 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  25.36 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  28.95 
 
 
516 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.38 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  21.82 
 
 
496 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  25.62 
 
 
517 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.62 
 
 
517 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.72 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>