More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1393 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  98.28 
 
 		 290 aa  583  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  97.59 
 
 		 290 aa  577  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  97.24 
 
 		 290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  96.21 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  94.48 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  59.45 
 
 		 291 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  95.08 
 
 		 236 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  59.45 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  50.85 
 
 		 288 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.48 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.8 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.7 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  45.02 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  42.86 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  36.75 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.04 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  36.04 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  35.69 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  31.13 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  29.61 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.88 
 
 		 637 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  34.48 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  25.99 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  25.99 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.43 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  32.28 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.88 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.35 
 
 		 472 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  28.85 
 
 		 614 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  28.96 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.93 
 
 		 529 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  24.55 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  25.75 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  24.62 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  25.75 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.78 
 
 		 523 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.95 
 
 		 513 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.3 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  25.41 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  27.35 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  26.02 
 
 		 438 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  31.75 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 197 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  25.58 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  23.5 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  23.81 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  26.54 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  23.53 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.37 
 
 		 451 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  25.41 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.57 
 
 		 440 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  25.84 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  21.05 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  23.63 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  27.43 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  21.05 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  24.59 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  20.87 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  22.84 
 
 		 433 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  22.77 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  33.61 
 
 		 451 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  26.13 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 506 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.53 
 
 		 566 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.08 
 
 		 489 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  24.18 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  26.78 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  20 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  23.19 
 
 		 441 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3073  GTP-binding protein EngA  24.88 
 
 		 435 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.348074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.15 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  20.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  20.43 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  23.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  26.63 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  25.32 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  28 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  29.75 
 
 		 494 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  28.65 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  27.45 
 
 		 550 aa  48.5  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  27.95 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  20.43 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  24.32 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  28.12 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>