70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5964 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1263    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  38.53 
 
 		 626 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  27.49 
 
 		 627 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  38.55 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  38.55 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  31.65 
 
 		 686 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  29.93 
 
 		 617 aa  94  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  31.69 
 
 		 610 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  31.52 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.13 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  34.63 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.2 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  35.2 
 
 		 603 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  33.85 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  30.29 
 
 		 608 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  32.22 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  27.34 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  31.8 
 
 		 407 aa  67  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1149  hypothetical protein  28.34 
 
 		 602 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  30.07 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  30.07 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  30.77 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  25.33 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.74 
 
 		 1219 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  30.47 
 
 		 640 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  29.17 
 
 		 602 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29 
 
 		 620 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.35 
 
 		 602 aa  53.9  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.51 
 
 		 564 aa  53.9  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.86 
 
 		 1219 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.9 
 
 		 1249 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  28.17 
 
 		 976 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  27.46 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.06 
 
 		 632 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.27 
 
 		 548 aa  51.2  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  27.68 
 
 		 624 aa  50.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.86 
 
 		 1219 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.34 
 
 		 583 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1219 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.86 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.62 
 
 		 741 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  30.88 
 
 		 679 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  30.39 
 
 		 660 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  30.08 
 
 		 741 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  36.36 
 
 		 546 aa  47.4  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  25.85 
 
 		 1228 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.29 
 
 		 523 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  29.85 
 
 		 571 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  22.33 
 
 		 789 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 743 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.74 
 
 		 693 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.1 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  23.56 
 
 		 693 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  31.5 
 
 		 496 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  36.25 
 
 		 701 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  22.83 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  28.26 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  32.77 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.29 
 
 		 585 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  31.79 
 
 		 493 aa  44.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  32.06 
 
 		 664 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1146 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1146 aa  43.9  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  31.48 
 
 		 468 aa  43.9  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>