47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3806 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 527 aa  994    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  41.65 
 
 		 501 aa  324  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  41.46 
 
 		 501 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  42.86 
 
 		 496 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  37.39 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  37.39 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  37.61 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  37.35 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  37.32 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  35.69 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30.06 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  35.81 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  40.92 
 
 		 420 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.41 
 
 		 533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  34.64 
 
 		 610 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  36.76 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  33.2 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  31.2 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  27.82 
 
 		 1164 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  36.89 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.67 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  31.69 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  31.5 
 
 		 666 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  38.4 
 
 		 608 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.59 
 
 		 588 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 602 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  37.27 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.82 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.92 
 
 		 546 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  40.68 
 
 		 737 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.75 
 
 		 620 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  30 
 
 		 686 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  38.6 
 
 		 693 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.37 
 
 		 674 aa  47.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  29.46 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  29.46 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  33.12 
 
 		 602 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  38.24 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.86 
 
 		 679 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  38.67 
 
 		 420 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  36.21 
 
 		 605 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  52.08 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  33.07 
 
 		 743 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1024  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.32 
 
 		 267 aa  43.9  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0965  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.32 
 
 		 267 aa  43.9  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  25.36 
 
 		 610 aa  43.9  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  27.88 
 
 		 976 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>