40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0922 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  100 
 
 
766 aa  1580    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0923  hypothetical protein  37.62 
 
 
309 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  25.21 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25.65 
 
 
620 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.74 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.34 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.34 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.74 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.34 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.66 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.5 
 
 
1219 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.66 
 
 
1219 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.74 
 
 
1219 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.07 
 
 
1228 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.69 
 
 
952 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  27.47 
 
 
615 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.94 
 
 
1219 aa  52.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.65 
 
 
614 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.65 
 
 
614 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.28 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  23.61 
 
 
648 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  46 
 
 
788 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.29 
 
 
585 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  23.08 
 
 
502 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  23.08 
 
 
502 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  23.08 
 
 
502 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  24.25 
 
 
496 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  42.11 
 
 
1249 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  31.25 
 
 
679 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.47 
 
 
588 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  24.64 
 
 
493 aa  46.6  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.28 
 
 
569 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3883  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 
742 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  37.88 
 
 
742 aa  44.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  23.81 
 
 
601 aa  44.7  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.88 
 
 
742 aa  44.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  37.88 
 
 
742 aa  44.3  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  37.88 
 
 
742 aa  44.3  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.4 
 
 
1164 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5622  hypothetical protein  37.88 
 
 
742 aa  44.3  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.889676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>