38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2958 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2958  GTPase  100 
 
 		 768 aa  1545    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000016463  unclonable  0.0000121851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.04 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.2 
 
 		 588 aa  71.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.31 
 
 		 605 aa  63.9  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  30.05 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  32.23 
 
 		 679 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.99 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.02 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.02 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  25.1 
 
 		 741 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  30.71 
 
 		 664 aa  54.7  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.12 
 
 		 666 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.7 
 
 		 686 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  26.67 
 
 		 605 aa  52.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  26.67 
 
 		 603 aa  51.2  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  25 
 
 		 620 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  28.79 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.94 
 
 		 1228 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.25 
 
 		 952 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.05 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  23.1 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  33.03 
 
 		 599 aa  47.8  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  19.84 
 
 		 1219 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0950  hypothetical protein  26.51 
 
 		 633 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0249813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  20.21 
 
 		 1219 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1219 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.15 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.15 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  22.22 
 
 		 601 aa  45.4  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  20.05 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  19.8 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1219 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.93 
 
 		 1164 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  25.18 
 
 		 602 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1219 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.29 
 
 		 693 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>