83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1090 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  100 
 
 		 737 aa  1404    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  61.79 
 
 		 667 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  65.18 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  57.75 
 
 		 784 aa  571  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  50.7 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  48.89 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  50.92 
 
 		 566 aa  459  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  48.52 
 
 		 584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  50.18 
 
 		 602 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  49.47 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  47.25 
 
 		 629 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  46.49 
 
 		 576 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  40.15 
 
 		 650 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  46.32 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  46.32 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  48.19 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  40.55 
 
 		 569 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.76 
 
 		 572 aa  356  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  37.04 
 
 		 564 aa  317  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  34.44 
 
 		 687 aa  300  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  34.59 
 
 		 619 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  32.54 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  36.13 
 
 		 551 aa  233  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  40.65 
 
 		 566 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  38.61 
 
 		 551 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.55 
 
 		 540 aa  183  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  42.63 
 
 		 526 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.96 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  31.17 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  32.18 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  35.2 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  31.08 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  27.24 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.64 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.24 
 
 		 550 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  32.88 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.25 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.25 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  31.63 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  30.88 
 
 		 590 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.95 
 
 		 542 aa  62  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  31.88 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  29.75 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  34.43 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  29.96 
 
 		 802 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  29.41 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  37.78 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  28.88 
 
 		 555 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.63 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  32.76 
 
 		 539 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.43 
 
 		 532 aa  54.7  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  32.88 
 
 		 673 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  28.48 
 
 		 524 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  30.05 
 
 		 517 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30.17 
 
 		 407 aa  52  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.2 
 
 		 564 aa  50.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  31.69 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.19 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  21.31 
 
 		 588 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1219 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.38 
 
 		 548 aa  47.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.82 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  30.36 
 
 		 547 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 523 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1219 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  26.95 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  25 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1396  hypothetical protein  26.85 
 
 		 794 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.318277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1219 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.5 
 
 		 585 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  26.05 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  24.55 
 
 		 632 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  20.75 
 
 		 1219 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  25.55 
 
 		 518 aa  44.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.26 
 
 		 583 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  23.5 
 
 		 605 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1070  hypothetical protein  26.67 
 
 		 798 aa  44.3  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>