74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2559 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  100 
 
 		 542 aa  1074    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  70.04 
 
 		 547 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  51.4 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  46.28 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  45.51 
 
 		 673 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.32 
 
 		 525 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  42.3 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  42.3 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  38.55 
 
 		 590 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  37.47 
 
 		 539 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.06 
 
 		 532 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.85 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  38.55 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  40.61 
 
 		 537 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  40.54 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  39.96 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.33 
 
 		 542 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  38.48 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.04 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  44.97 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  32.77 
 
 		 589 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  47.89 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  32.73 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  46.35 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.69 
 
 		 578 aa  196  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  40.13 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  41.94 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  39.74 
 
 		 523 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  34.69 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.74 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  38.69 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  29.3 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  31.05 
 
 		 619 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  33.82 
 
 		 687 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  29.84 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  34.93 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.02 
 
 		 602 aa  59.7  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  31.79 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  28.57 
 
 		 551 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 631 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 526 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  29.18 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  26.73 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.24 
 
 		 569 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  29.11 
 
 		 667 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  30.43 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  28.12 
 
 		 642 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  29.89 
 
 		 566 aa  51.6  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  22.93 
 
 		 291 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.4 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.4 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.11 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  29.35 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  29.91 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  29.91 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.47 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  30.4 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  29.35 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.88 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  29.15 
 
 		 650 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  30.25 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  30.25 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  23.88 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.61 
 
 		 1164 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  25.81 
 
 		 1219 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1219 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  26.78 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1219 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1219 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1219 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  23.38 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.2 
 
 		 291 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  29.9 
 
 		 449 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>