249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3402 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  99.66 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  96.6 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  94.56 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  39.58 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  38.35 
 
 		 291 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  35.96 
 
 		 291 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  40.43 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.51 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  36.55 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  36.75 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.4 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  36.04 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.95 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  32.43 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  32 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  29.21 
 
 		 489 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  30.28 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  32.04 
 
 		 484 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.99 
 
 		 492 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.76 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  25.57 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  25.37 
 
 		 475 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  27.2 
 
 		 460 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.15 
 
 		 637 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  26.09 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  31.91 
 
 		 529 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  30.09 
 
 		 467 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.39 
 
 		 512 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  26.11 
 
 		 614 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  25.4 
 
 		 635 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05518  GTP binding protein (EngB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13010)  35.94 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  31.87 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.65 
 
 		 529 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  25.45 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  24.65 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  26.36 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  27.38 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  23.3 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  29.52 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  23.38 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  24.62 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  25.4 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  30 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  27.56 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  22.89 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  22.89 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  25 
 
 		 539 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  22.89 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  31.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.38 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.72 
 
 		 440 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.73 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  25.46 
 
 		 578 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  26.7 
 
 		 518 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  29.09 
 
 		 454 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  24.77 
 
 		 452 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  22.29 
 
 		 442 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  25.61 
 
 		 460 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  23.26 
 
 		 480 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  27.57 
 
 		 537 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  32.97 
 
 		 448 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 		 460 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  23.26 
 
 		 473 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.71 
 
 		 457 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  32.97 
 
 		 448 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.64 
 
 		 513 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  28.57 
 
 		 456 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 		 460 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  29.13 
 
 		 459 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 445 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  27.88 
 
 		 531 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  29.13 
 
 		 459 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  27.88 
 
 		 531 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  24.3 
 
 		 439 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  22.75 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  23.85 
 
 		 490 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 506 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.43 
 
 		 534 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.27 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  29.7 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  28.44 
 
 		 448 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  28.43 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>