65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1367 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  100 
 
 		 555 aa  1062    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  45.31 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  45.79 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  45.79 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  45.42 
 
 		 525 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  42.55 
 
 		 539 aa  329  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  43.11 
 
 		 564 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  40.54 
 
 		 673 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.6 
 
 		 532 aa  296  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  42.69 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  38.82 
 
 		 542 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.98 
 
 		 547 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.69 
 
 		 550 aa  286  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  39.26 
 
 		 802 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  41.39 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  38.72 
 
 		 568 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.02 
 
 		 586 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.49 
 
 		 542 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  42.72 
 
 		 532 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  40.92 
 
 		 539 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  35.21 
 
 		 589 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  39.4 
 
 		 568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  47.29 
 
 		 524 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  46.55 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  48.81 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.14 
 
 		 578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  47.93 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  41.79 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  46.28 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  31.16 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.58 
 
 		 631 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  33 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  32.09 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  34.01 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  29.65 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  31.07 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  26.32 
 
 		 571 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  30.14 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  35 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.79 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.83 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  31.12 
 
 		 566 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  28.25 
 
 		 540 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  29.9 
 
 		 571 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  31.87 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  31.18 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  29.9 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  29.59 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  29.13 
 
 		 584 aa  50.4  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  28.19 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  30.13 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2193  GTP-binding proten HflX  30.77 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  29 
 
 		 586 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  29 
 
 		 586 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  30.9 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  29 
 
 		 576 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  31 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  28.19 
 
 		 650 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0929  GTP-binding protein LepA  29.76 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0259799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  25.3 
 
 		 786 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.33 
 
 		 637 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.13 
 
 		 644 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  25.71 
 
 		 299 aa  43.9  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0623  ferrous iron transport protein B  24.49 
 
 		 240 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000038054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>