74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1055    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  54.32 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  48.23 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  44.94 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 526 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  39.55 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  39.11 
 
 		 602 aa  204  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  37.63 
 
 		 571 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  35.74 
 
 		 667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.12 
 
 		 569 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  34.19 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  38.68 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  31.99 
 
 		 687 aa  194  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  39.94 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  39.64 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  39.64 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  35.84 
 
 		 572 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  40.88 
 
 		 571 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  36.76 
 
 		 669 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  39.55 
 
 		 737 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  38.94 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  34.23 
 
 		 650 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  36.15 
 
 		 629 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  36.23 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.55 
 
 		 619 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  40.21 
 
 		 784 aa  160  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.7 
 
 		 631 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.3 
 
 		 556 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  31.92 
 
 		 589 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  35.8 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  33.9 
 
 		 802 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  33.77 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  32.42 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  38.79 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  34.73 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  30.48 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.41 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.44 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.63 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.29 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  37.9 
 
 		 564 aa  62  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  34.48 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.27 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.27 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  32.54 
 
 		 673 aa  57.4  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.27 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.77 
 
 		 642 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  31.82 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  30.99 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  30.29 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.33 
 
 		 548 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  28.12 
 
 		 523 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  31.85 
 
 		 618 aa  54.3  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  29.58 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.32 
 
 		 1249 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.57 
 
 		 583 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  29.24 
 
 		 586 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  29.93 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  32.26 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.95 
 
 		 546 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  21.43 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  30.43 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  33.9 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.87 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.75 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  29.17 
 
 		 518 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30.09 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.33 
 
 		 564 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  27.04 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.26 
 
 		 1164 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.94 
 
 		 589 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.59 
 
 		 632 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6055  tRNA modification GTPase TrmE  42.35 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  26.9 
 
 		 267 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>