54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3997 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1305    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  28.15 
 
 		 631 aa  77  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  27.41 
 
 		 619 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  26.73 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  29.96 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.08 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  26.2 
 
 		 571 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  29.53 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  26.2 
 
 		 571 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  28.83 
 
 		 602 aa  62.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  29.59 
 
 		 629 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  23.26 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  27.57 
 
 		 564 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  30.41 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.74 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  30 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  25.86 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  26.77 
 
 		 551 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  26.75 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  26.32 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  28.49 
 
 		 539 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  27.78 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  25.65 
 
 		 802 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.07 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  28.12 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  26.51 
 
 		 784 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  25.95 
 
 		 565 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  28.43 
 
 		 590 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  24.89 
 
 		 572 aa  51.2  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  29.44 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  27.78 
 
 		 673 aa  50.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  26.27 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  26.27 
 
 		 576 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  26.27 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  25.15 
 
 		 568 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  29.28 
 
 		 525 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  29.95 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.28 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.28 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  24.58 
 
 		 523 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  27.24 
 
 		 737 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  27.37 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  25.84 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  24.29 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  26.14 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  25.54 
 
 		 524 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  28.95 
 
 		 556 aa  44.3  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  28 
 
 		 532 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  26.9 
 
 		 539 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1219 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1219 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>