77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0933 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1138    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  37.54 
 
 		 539 aa  263  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.58 
 
 		 550 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  34.54 
 
 		 539 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.81 
 
 		 564 aa  219  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  33.52 
 
 		 537 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.21 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  34.07 
 
 		 590 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  32.1 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  32.31 
 
 		 547 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  35.88 
 
 		 673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  35.69 
 
 		 585 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  32.25 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  32.25 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  32.25 
 
 		 525 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  32.01 
 
 		 802 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  33.52 
 
 		 586 aa  179  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  31.32 
 
 		 568 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  33.14 
 
 		 568 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  33.1 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  33.15 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.78 
 
 		 532 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.24 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  28.04 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  34.04 
 
 		 524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  37.27 
 
 		 552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  34.74 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  35.65 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  32.97 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  31.11 
 
 		 571 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  35.58 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  33.52 
 
 		 564 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  29.12 
 
 		 687 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  29.77 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  31.52 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  30.48 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  35.33 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  32.83 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.02 
 
 		 619 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.99 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  27.79 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.85 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.5 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.62 
 
 		 548 aa  53.9  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  29.94 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  20.06 
 
 		 692 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  29.75 
 
 		 737 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  34.93 
 
 		 629 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  27.59 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 526 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  31.98 
 
 		 669 aa  50.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  28.25 
 
 		 586 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  28.25 
 
 		 586 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  32.77 
 
 		 576 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  30.53 
 
 		 572 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  33.57 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.76 
 
 		 543 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.09 
 
 		 1164 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.63 
 
 		 728 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.15 
 
 		 728 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  25.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  21.63 
 
 		 728 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.54 
 
 		 565 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  26.92 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  24.54 
 
 		 294 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.6 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  21.52 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.21 
 
 		 587 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  25 
 
 		 294 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  32.08 
 
 		 784 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.93 
 
 		 605 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.58 
 
 		 614 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.58 
 
 		 614 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>