87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  100 
 
 		 564 aa  1082    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  45.18 
 
 		 590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  42.64 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  42.64 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.64 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  40.86 
 
 		 539 aa  296  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.37 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.74 
 
 		 532 aa  286  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  40.69 
 
 		 537 aa  282  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.82 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  43.28 
 
 		 555 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  41.82 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  40.37 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.66 
 
 		 547 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  35.17 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  40.58 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  43.81 
 
 		 532 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  35.8 
 
 		 673 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  36.45 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  38.59 
 
 		 568 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  34.81 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  35.61 
 
 		 802 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  37.79 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  45.42 
 
 		 524 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  45.7 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  35.01 
 
 		 552 aa  186  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  40.76 
 
 		 518 aa  180  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  45.97 
 
 		 453 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  44.14 
 
 		 517 aa  173  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.62 
 
 		 631 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  35.39 
 
 		 569 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  34.9 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  32.16 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  34.36 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  34.59 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  30.99 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  35.18 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  34.87 
 
 		 584 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  36.11 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  38.86 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  33.49 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  34.76 
 
 		 565 aa  67  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  38.21 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.93 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  32.95 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  35.37 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  30.46 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  32.08 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  28.71 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  34.29 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  34.29 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  34.29 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  33.69 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  37.24 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  35.8 
 
 		 556 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  24.02 
 
 		 583 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  28.33 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.74 
 
 		 546 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.85 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  28.57 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  38.03 
 
 		 737 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.38 
 
 		 548 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.56 
 
 		 1219 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.35 
 
 		 666 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  25.34 
 
 		 340 aa  47.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.81 
 
 		 472 aa  47.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  21.93 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.33 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1219 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  21.08 
 
 		 1219 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  20.48 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  46.67 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.51 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  20.99 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  43.08 
 
 		 650 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1219 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  40.79 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.35 
 
 		 1249 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  23.36 
 
 		 291 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05610  essential conserved GTPase, putative  25.22 
 
 		 525 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>