75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2522 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  100 
 
 		 539 aa  1036    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  76.68 
 
 		 537 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  50.18 
 
 		 586 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  44.66 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  45.2 
 
 		 539 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.62 
 
 		 550 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  42.69 
 
 		 525 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  42.69 
 
 		 525 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  42.69 
 
 		 525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.39 
 
 		 542 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  43.68 
 
 		 585 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  47.41 
 
 		 568 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  42.21 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  40.31 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.35 
 
 		 532 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  36.33 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  38.29 
 
 		 547 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  38.45 
 
 		 673 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.27 
 
 		 802 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  46.07 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  36.07 
 
 		 568 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  33.39 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  44.44 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  33.18 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  38.41 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  45 
 
 		 453 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  43.36 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  38.66 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  39.44 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.97 
 
 		 543 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  28.73 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.87 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  32.46 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  36.81 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  31.25 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  32.43 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  33.51 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  37.33 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  33.49 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  31.55 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.37 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  29.85 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  34.67 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  31.33 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  34.48 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  29.32 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  34.19 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  31.58 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  32.37 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  32.37 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  31.11 
 
 		 576 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  31.98 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.56 
 
 		 1249 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  30.98 
 
 		 571 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  35.44 
 
 		 556 aa  54.3  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  30.3 
 
 		 650 aa  53.9  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  29.47 
 
 		 669 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.78 
 
 		 1228 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  25 
 
 		 294 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25 
 
 		 294 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  27.84 
 
 		 635 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  25 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  28.08 
 
 		 784 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  20.22 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.27 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  25.97 
 
 		 294 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  23.2 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  24.72 
 
 		 607 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.65 
 
 		 220 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  26.67 
 
 		 566 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2672  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.18 
 
 		 216 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922288  normal  0.0302457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  27.36 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  21.71 
 
 		 305 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  32.39 
 
 		 737 aa  43.5  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>