69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6775 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  100 
 
 		 589 aa  1169    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  34.93 
 
 		 525 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  34.93 
 
 		 525 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  34.74 
 
 		 525 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  34.59 
 
 		 673 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  33.7 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  33.52 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  32.49 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 590 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  36.19 
 
 		 585 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  33.27 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  36.73 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.44 
 
 		 532 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  37.59 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  35.49 
 
 		 539 aa  200  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  33.59 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.46 
 
 		 542 aa  197  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.39 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  43.01 
 
 		 517 aa  190  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  43.4 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  34.38 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  43.31 
 
 		 453 aa  182  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  41.56 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  41.84 
 
 		 523 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  32.98 
 
 		 586 aa  171  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  33.03 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  33.56 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  31.15 
 
 		 568 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  27.81 
 
 		 578 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.69 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  33.47 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  32.05 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  31.92 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  36 
 
 		 631 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  34.22 
 
 		 566 aa  72  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  29.89 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.63 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  30.35 
 
 		 687 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  26.91 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  29.49 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  29.49 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  29.49 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  30.37 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.14 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  34.65 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  33.01 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  30.9 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  33.15 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  30.85 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 667 aa  57  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.69 
 
 		 584 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  30.95 
 
 		 571 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  28.28 
 
 		 543 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.44 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  28.72 
 
 		 572 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  31.92 
 
 		 737 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.88 
 
 		 589 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  29.52 
 
 		 404 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.26 
 
 		 585 aa  47  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.65 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  27.41 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.27 
 
 		 1249 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.18 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.18 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.56 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.14 
 
 		 642 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  32.19 
 
 		 905 aa  44.3  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.64 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>