70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1394 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1093    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  30.97 
 
 		 539 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  34.95 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  32.35 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  33.33 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  28.85 
 
 		 673 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  32.84 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  29.67 
 
 		 802 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  30.96 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  31.35 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  28.88 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  32.18 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  30.17 
 
 		 618 aa  73.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  31.22 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  29.95 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  33.93 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  27.92 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.74 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.02 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  28.63 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  29.41 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  29.41 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  31.18 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.22 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.42 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  30.1 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  26.35 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  26.9 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  32.42 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  34.83 
 
 		 571 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  28.95 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  31.82 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.85 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  30.59 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  33.86 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.72 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  33.17 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  25.85 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  26.04 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  29.63 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.83 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  32.24 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  29.35 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  35 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.79 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  30.77 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  29.28 
 
 		 569 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  27.5 
 
 		 546 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  28.28 
 
 		 589 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  28.34 
 
 		 650 aa  53.9  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.83 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  31.76 
 
 		 737 aa  51.6  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  25.11 
 
 		 590 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  27.86 
 
 		 784 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.75 
 
 		 587 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.76 
 
 		 578 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  48.98 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.09 
 
 		 548 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  27.15 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  24.66 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  26.74 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  46.51 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  30.51 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  21.47 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  26.35 
 
 		 288 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  23.29 
 
 		 291 aa  43.9  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>