93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2640 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 550 aa  1018    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  56.26 
 
 		 585 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  57.79 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  51.55 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  49.41 
 
 		 590 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  47.48 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  47.29 
 
 		 525 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  47.29 
 
 		 525 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  46.04 
 
 		 539 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  46.06 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  45.37 
 
 		 564 aa  322  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.22 
 
 		 532 aa  319  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  46.23 
 
 		 586 aa  302  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  40.22 
 
 		 542 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  48.51 
 
 		 532 aa  300  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  44.69 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  39.6 
 
 		 568 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  46.48 
 
 		 568 aa  286  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  37.97 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  40.17 
 
 		 578 aa  276  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  37.97 
 
 		 673 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.96 
 
 		 802 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  36.04 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  46.25 
 
 		 517 aa  213  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  42.94 
 
 		 518 aa  208  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  43.94 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  35.78 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  39.8 
 
 		 453 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  46.43 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  35.94 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  33.71 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  34.95 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  33.95 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  31.44 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  32.53 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  36.21 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  36.02 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  32.53 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  33.86 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  35.95 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  33.96 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.67 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  35.18 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1219 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1219 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.23 
 
 		 1219 aa  63.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1219 aa  63.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  30.66 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1219 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1219 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.65 
 
 		 1228 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  25.41 
 
 		 1219 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  30.28 
 
 		 687 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  36.41 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  32.62 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1219 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  32.5 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  35.23 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  25.73 
 
 		 1219 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  24.34 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  32.62 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  32.62 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  32.62 
 
 		 576 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  31.22 
 
 		 571 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.61 
 
 		 1249 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  29.17 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  35.05 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  34.47 
 
 		 784 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  33.15 
 
 		 629 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  37.24 
 
 		 737 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.05 
 
 		 632 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 411 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.84 
 
 		 548 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  36.21 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.03 
 
 		 566 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.19 
 
 		 583 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  26.79 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  23.49 
 
 		 291 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.05 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  26.62 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0968  small GTP-binding protein  35 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.81 
 
 		 405 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1146 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  28.23 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  27.36 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1146 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  28.23 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  24.56 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.16 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  22.82 
 
 		 666 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>