More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2411 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  100 
 
 		 413 aa  842    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  61.08 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  48.79 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  47.52 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  46.48 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  48 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  40.15 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  38.13 
 
 		 414 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  40.4 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37.35 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  40.85 
 
 		 485 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  37.94 
 
 		 502 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  40.48 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  37.46 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  37.69 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  39.12 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.12 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  38.82 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  39.19 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  37.5 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  36.93 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  37.41 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  39.83 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  40 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  39.76 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  36.53 
 
 		 444 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  39.54 
 
 		 435 aa  200  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  40.48 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  39.3 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  40 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  41.96 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  39.41 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  39.41 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  39.41 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  37.85 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  37.85 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 		 596 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  40.23 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  38.46 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  37.34 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  36.18 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  37.81 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  37.34 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  38.18 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  37.74 
 
 		 512 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.25 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.76 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  38.48 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  36.42 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  36.23 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2447  GTP-binding proten HflX  35.61 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  39.77 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  39.31 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  42.81 
 
 		 509 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  37 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  40.69 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  40.69 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  35.84 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  38.38 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  40.46 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  37.75 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  38.66 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  35.05 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  36.43 
 
 		 474 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  38.67 
 
 		 372 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  40.68 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  40.68 
 
 		 435 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  40.4 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  38.66 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  40.4 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  36.97 
 
 		 561 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  37.03 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  37.17 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  35.43 
 
 		 479 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  40.74 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  36.21 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  37.46 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  41.67 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  34.84 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  37.4 
 
 		 515 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  35.2 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  38.55 
 
 		 564 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  38.04 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  38.55 
 
 		 564 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.86 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  33.91 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  41.76 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  38.82 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  39.27 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  38.82 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  34.41 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  38.48 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  36.01 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.48 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  38.82 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  38.82 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  38.82 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>