257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3202 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  94.56 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  95.24 
 
 		 294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  94.22 
 
 		 294 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  40.28 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  38.35 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  35.79 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  39.13 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.8 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  36.55 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  36.75 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  36.75 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  37.1 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.34 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.26 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  33.51 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  35.43 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  30.2 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  25.63 
 
 		 475 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  27.2 
 
 		 460 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  29.58 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.22 
 
 		 637 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  25.82 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  29.81 
 
 		 441 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  25.31 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  32.38 
 
 		 489 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  27.41 
 
 		 524 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  26.06 
 
 		 529 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  25.27 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.34 
 
 		 529 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  26.96 
 
 		 614 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  25.93 
 
 		 447 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  28.36 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  29.53 
 
 		 484 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  30 
 
 		 447 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  23.59 
 
 		 445 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  24.46 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  30.63 
 
 		 467 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.38 
 
 		 460 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  31.13 
 
 		 496 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  30.65 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  31.11 
 
 		 440 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  23.91 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  30.48 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  25.23 
 
 		 439 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05518  GTP binding protein (EngB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13010)  37.5 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  29.09 
 
 		 454 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.11 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.58 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.9 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.79 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.79 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  31.13 
 
 		 447 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  26.19 
 
 		 460 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  27.17 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.68 
 
 		 457 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  22.75 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  27.93 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  28.71 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  29.41 
 
 		 635 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  27.82 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  25.74 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  35.44 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  38.1 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  35 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  31.46 
 
 		 506 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  32.79 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  24.3 
 
 		 439 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  28.23 
 
 		 464 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.46 
 
 		 517 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  28.83 
 
 		 445 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.98 
 
 		 431 aa  46.6  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  27.72 
 
 		 537 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  26.17 
 
 		 447 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  28.83 
 
 		 445 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  27.93 
 
 		 445 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.43 
 
 		 534 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  27.34 
 
 		 443 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  28.18 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  27.34 
 
 		 443 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  26.74 
 
 		 518 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  30.85 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  21.86 
 
 		 337 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  28.46 
 
 		 440 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  30.63 
 
 		 456 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>