20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0774 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1074    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  45.93 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  43.7 
 
 		 556 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  29.61 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  32.09 
 
 		 204 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  27.96 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.23 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  27.72 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.18 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.27 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  28.86 
 
 		 674 aa  50.4  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  28.02 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  26.9 
 
 		 583 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.15 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  24.42 
 
 		 788 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  32.11 
 
 		 599 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  22.94 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.27 
 
 		 587 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.57 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.79 
 
 		 615 aa  43.9  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>