More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1155 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2206  protein synthesis factor GTP-binding protein  78.47 
 
 		 551 aa  819    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1155  protein synthesis factor GTP-binding  100 
 
 		 545 aa  1068    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1813  protein synthesis factor GTP-binding  81.59 
 
 		 557 aa  887    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0070  protein synthesis factor GTP-binding  75.92 
 
 		 540 aa  824    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0200  protein synthesis factor GTP-binding protein  76.56 
 
 		 533 aa  831    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0642  translation elongation factor 1A GTP binding subunit  36.31 
 
 		 520 aa  306  9.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.111527  normal  0.300647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0233  protein synthesis factor GTP-binding protein  35.44 
 
 		 523 aa  295  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0137  elongation factor Tu domain-containing protein  35.65 
 
 		 524 aa  286  8e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10003  GTP binding protein (GTPBP1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12580)  31.2 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29069  predicted protein  33.04 
 
 		 594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0832237  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0547  translation elongation factor 1A GTP binding subunit  37.59 
 
 		 520 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9185  predicted protein  33.58 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1723  protein synthesis factor, GTP-binding  35.9 
 
 		 519 aa  249  9e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.649328 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0756  protein synthesis factor, GTP-binding  34.57 
 
 		 517 aa  236  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0741  protein synthesis factor GTP-binding  34.59 
 
 		 519 aa  229  9e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04780  GTP-binding protein 1 (g-protein 1), putative  29.37 
 
 		 623 aa  200  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  32.54 
 
 		 395 aa  160  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  32.3 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  32.56 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  32.64 
 
 		 400 aa  156  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  31.68 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  31.68 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  31.15 
 
 		 399 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  31.34 
 
 		 399 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  31.34 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  31.34 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  31.35 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  30.68 
 
 		 399 aa  150  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  31.34 
 
 		 399 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  31.52 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  30.42 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  30.5 
 
 		 400 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  30.56 
 
 		 400 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  30.42 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  30.23 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  30.35 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  31.24 
 
 		 396 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  31.24 
 
 		 396 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  30.18 
 
 		 400 aa  146  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  30.23 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  31.12 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  29.38 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  30.81 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  30.81 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  31.21 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  31.21 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  30.09 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  30.23 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  29.91 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  29.91 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  30.32 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 394 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  30.66 
 
 		 394 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  30.32 
 
 		 400 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  30.97 
 
 		 396 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  29.88 
 
 		 395 aa  143  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  30.57 
 
 		 400 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  30.97 
 
 		 396 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000805833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  30.57 
 
 		 400 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  31.03 
 
 		 384 aa  143  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  30.28 
 
 		 397 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  30.42 
 
 		 394 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  30.42 
 
 		 394 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  31.03 
 
 		 384 aa  143  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2101  elongation factor Tu  30.97 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.235673  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  28.67 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2114  elongation factor Tu  30.97 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  29.69 
 
 		 401 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  29.69 
 
 		 401 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  28.67 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  30.23 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  27.87 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  30 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  30 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  29.2 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  30.48 
 
 		 394 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4007  translation elongation factor Tu  29.81 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206581  normal  0.828758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4022  translation elongation factor Tu  29.81 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  29.21 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  29.76 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  141  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.61 
 
 		 400 aa  141  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  30.33 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  141  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  141  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  30.02 
 
 		 397 aa  141  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  30.57 
 
 		 400 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2707  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.07 
 
 		 636 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  30.91 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  30.57 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1338  translation elongation factor Tu  30.26 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  29.23 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  29.81 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  29.81 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  29.08 
 
 		 400 aa  140  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.02 
 
 		 627 aa  140  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  29.65 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>