More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0951 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  80.5 
 
 		 399 aa  672    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  86 
 
 		 400 aa  716    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  85 
 
 		 400 aa  706    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77.5 
 
 		 397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  811    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  85 
 
 		 400 aa  706    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77.5 
 
 		 397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 400 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  75.31 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  73.82 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  75.31 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  73.83 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  73.83 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 405 aa  608  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 405 aa  608  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.5 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 399 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71.75 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.82 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  69.58 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.8 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  69 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  69 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  69 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  69 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  69.21 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4028  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  hitchhiker  0.00000974612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  71.64 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  71.25 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  69.06 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  71.25 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  68 
 
 		 395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  70.93 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  70.52 
 
 		 405 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 400 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0447  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 394 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  67.5 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>