14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2153 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2153  kinase  100 
 
 
363 aa  748    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  39.07 
 
 
411 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1600  hypothetical protein  35.73 
 
 
406 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.406561  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  28.65 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  27.23 
 
 
435 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  26.82 
 
 
432 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  24.15 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  25.14 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  25.9 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  22.44 
 
 
444 aa  53.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1560  hypothetical protein  24.03 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  26.39 
 
 
192 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  22.83 
 
 
355 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>