266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3137 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  43.2 
 
 
291 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.41 
 
 
287 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  43.54 
 
 
291 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  43.77 
 
 
290 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  43.77 
 
 
290 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  43.77 
 
 
290 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  43.43 
 
 
290 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.01 
 
 
287 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  41.02 
 
 
288 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  42.86 
 
 
290 aa  224  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  42.76 
 
 
290 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.56 
 
 
291 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  39.51 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  36.36 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  36.55 
 
 
294 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  36.55 
 
 
294 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  36.55 
 
 
294 aa  198  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  41.05 
 
 
236 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  30.58 
 
 
442 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  30.58 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  27.27 
 
 
629 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  26.5 
 
 
398 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.48 
 
 
440 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.48 
 
 
440 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  24.75 
 
 
523 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.39 
 
 
637 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  31.62 
 
 
650 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  25.16 
 
 
473 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  25.16 
 
 
480 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  29.2 
 
 
484 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2222  tRNA modification GTPase TrmE  34.13 
 
 
451 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  27.48 
 
 
448 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2312  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 
451 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00480658  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  26.51 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  23.97 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  28.66 
 
 
446 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  29.92 
 
 
446 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  30.37 
 
 
635 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.82 
 
 
440 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  23.9 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  26.72 
 
 
442 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.39 
 
 
492 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  25 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  26.64 
 
 
453 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  22.94 
 
 
455 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  24.81 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  30.49 
 
 
444 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  27.12 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  29.23 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  25.33 
 
 
494 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  25 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  28.33 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  26.06 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.93 
 
 
512 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  25.17 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  40.54 
 
 
669 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  28 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  30.47 
 
 
460 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  22.27 
 
 
465 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  20.65 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  28 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  31.52 
 
 
447 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  27.74 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  22.64 
 
 
461 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  29.79 
 
 
566 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.91 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  25.56 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  29.23 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  31.52 
 
 
447 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.28 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  25.13 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  26.79 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  24.07 
 
 
462 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  27.13 
 
 
446 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  22.83 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  27.98 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  32.61 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  27.27 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  25.96 
 
 
468 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  25.64 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  23.78 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0738  ribosome-associated GTPase EngA  34.07 
 
 
484 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.922813  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0555  tRNA modification GTPase TrmE  24.59 
 
 
438 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  30.53 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  26.02 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>