23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74138 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_74138  septin  100 
 
 
345 aa  710    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.314588  normal  0.29916 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  57.14 
 
 
342 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04860  septin ring protein, putative  60.4 
 
 
322 aa  401  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00500  septin ring protein, putative  41.3 
 
 
543 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0927358  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08182  Septin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M2]  38.76 
 
 
384 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373113 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02440  cytokinesis-related protein, putative  41.67 
 
 
380 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390899  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06688  Septin B [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78620]  41.22 
 
 
459 aa  225  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.943989  normal  0.301462 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03430  septin, putative  38.1 
 
 
390 aa  209  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0994404  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61997  predicted protein  37.46 
 
 
368 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.132293  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84419  predicted protein  37.22 
 
 
432 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04667  Septin [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M3]  34.8 
 
 
379 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55755  normal  0.764569 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_3603  predicted protein  36.55 
 
 
390 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137425  normal  0.150378 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65385  predicted protein  33.64 
 
 
602 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47429  predicted protein  29.93 
 
 
299 aa  143  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112208  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_19189  predicted protein  30.94 
 
 
390 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0678  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.73 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.650782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1349  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.73 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.761915  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0753  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.18 
 
 
198 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  32.94 
 
 
635 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10595  Septin [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M0]  19.15 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000111129  normal  0.249014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  23.97 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  28.7 
 
 
481 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  64 
 
 
650 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>