15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3699 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3699  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0807285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1955  GTPase domain-containing protein  36.67 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.387211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0877  GTPase domain-containing protein  34.58 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000876255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0267  GTPase domain-containing protein  30.56 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.137333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1715  hypothetical protein  30.23 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691695  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1142  hypothetical protein  28.04 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1164  hypothetical protein  28.04 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  28.32 
 
 		 444 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 462 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  27.45 
 
 		 355 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0668  hypothetical protein  26.45 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0219  hypothetical protein  25.32 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  25.47 
 
 		 453 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  34.95 
 
 		 432 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1262  hypothetical protein  32.8 
 
 		 378 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0244924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>