33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0565 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  82.36 
 
 
689 aa  1197    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  69.9 
 
 
670 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  57.29 
 
 
694 aa  803    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  65.24 
 
 
703 aa  962    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  100 
 
 
686 aa  1419    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  46.85 
 
 
675 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  50.39 
 
 
678 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  46.74 
 
 
676 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  47.18 
 
 
686 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  47.09 
 
 
679 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  48.03 
 
 
694 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  49.16 
 
 
687 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  46.41 
 
 
676 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 
679 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  45.32 
 
 
676 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  43.78 
 
 
678 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  41.34 
 
 
684 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  40.12 
 
 
681 aa  351  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  36.77 
 
 
682 aa  348  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  37.23 
 
 
684 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  39.14 
 
 
682 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  37.37 
 
 
681 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37.99 
 
 
682 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  31.65 
 
 
531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  31.5 
 
 
508 aa  233  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 
469 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28 
 
 
477 aa  193  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  29.98 
 
 
470 aa  188  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  29.4 
 
 
473 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 
485 aa  168  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.77 
 
 
485 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  30.17 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  30.6 
 
 
914 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>