32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1063 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  969    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  56.93 
 
 
470 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  43.51 
 
 
469 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  36.21 
 
 
531 aa  282  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  35.1 
 
 
508 aa  256  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  29.14 
 
 
676 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  32.5 
 
 
473 aa  230  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  28.7 
 
 
679 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  28.94 
 
 
686 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 
687 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  29.81 
 
 
684 aa  223  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  27.67 
 
 
694 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  29.85 
 
 
694 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  28.45 
 
 
678 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  29.85 
 
 
676 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  28.94 
 
 
670 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 
679 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  29.77 
 
 
676 aa  212  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  28.54 
 
 
689 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  28.99 
 
 
703 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  28.88 
 
 
682 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  28.84 
 
 
681 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  28 
 
 
686 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
485 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  28.87 
 
 
682 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  29.2 
 
 
684 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  29.57 
 
 
682 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  31.2 
 
 
485 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  27.29 
 
 
681 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  26.14 
 
 
678 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  26.74 
 
 
675 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 
186 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>