More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2283 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  76.71 
 
 
676 aa  1111    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  72.88 
 
 
694 aa  1068    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  61.83 
 
 
687 aa  880    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  74.93 
 
 
686 aa  1095    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  64.53 
 
 
678 aa  924    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  100 
 
 
679 aa  1404    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  47.64 
 
 
676 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  45.19 
 
 
678 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  44.05 
 
 
676 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 
679 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  41.92 
 
 
684 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  39.53 
 
 
682 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  40.68 
 
 
684 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  39.34 
 
 
682 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.31 
 
 
681 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  47.09 
 
 
686 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  47.34 
 
 
689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  39.11 
 
 
681 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  37.85 
 
 
682 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  48.07 
 
 
670 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  47.19 
 
 
703 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  47.52 
 
 
694 aa  432  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  43.91 
 
 
675 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.55 
 
 
531 aa  266  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  35.07 
 
 
470 aa  253  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.95 
 
 
508 aa  253  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 
469 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28.7 
 
 
477 aa  218  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  30.82 
 
 
473 aa  207  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  28.85 
 
 
485 aa  191  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.79 
 
 
485 aa  184  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  28.74 
 
 
186 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  27.43 
 
 
812 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  26.44 
 
 
819 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  27.76 
 
 
812 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.3 
 
 
812 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 
779 aa  69.3  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  25.09 
 
 
810 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 
797 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  27.16 
 
 
798 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  29.73 
 
 
787 aa  68.6  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  25.13 
 
 
783 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 
846 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 
815 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 
801 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  29.29 
 
 
815 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 
820 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 
818 aa  65.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  27.21 
 
 
805 aa  65.1  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 
825 aa  65.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  26.25 
 
 
794 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
813 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  26.6 
 
 
820 aa  65.1  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  25.53 
 
 
797 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
779 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  25 
 
 
778 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  25.39 
 
 
793 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  26.81 
 
 
682 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  30 
 
 
774 aa  64.3  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  25 
 
 
780 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  26.2 
 
 
804 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  25.7 
 
 
856 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  26.25 
 
 
819 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  26.85 
 
 
786 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  28.39 
 
 
809 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  26.67 
 
 
768 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  24.04 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 
783 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 
783 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  27.61 
 
 
803 aa  62.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 
783 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  26.25 
 
 
821 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  27.4 
 
 
807 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  24.46 
 
 
802 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  22.97 
 
 
774 aa  62.4  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 
788 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 
792 aa  62.4  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 
775 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
773 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  29.03 
 
 
776 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  25.7 
 
 
798 aa  62  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
773 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  25.3 
 
 
793 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  28.06 
 
 
675 aa  61.6  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 
783 aa  62  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
776 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
776 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.49 
 
 
784 aa  61.6  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 
773 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
776 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  29.03 
 
 
776 aa  61.6  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
776 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  26.8 
 
 
823 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  28.67 
 
 
811 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  29.03 
 
 
776 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  28.67 
 
 
796 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  26 
 
 
784 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  26 
 
 
784 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  26 
 
 
784 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  26 
 
 
784 aa  61.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>