224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2752 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  68.42 
 
 
682 aa  973    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  66.23 
 
 
684 aa  950    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  74.38 
 
 
681 aa  1073    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  59.03 
 
 
681 aa  865    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 
682 aa  1402    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  74.23 
 
 
682 aa  1078    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  39.26 
 
 
686 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  39.53 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  38.88 
 
 
676 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  39.65 
 
 
694 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  37.57 
 
 
687 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  38.01 
 
 
678 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  37.79 
 
 
678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  37.55 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  36.92 
 
 
679 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  37.74 
 
 
676 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  34.16 
 
 
684 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  37.86 
 
 
689 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  37 
 
 
670 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  37.99 
 
 
686 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  36.58 
 
 
703 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  38.43 
 
 
694 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  38.17 
 
 
675 aa  286  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  34.79 
 
 
508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.26 
 
 
531 aa  232  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.81 
 
 
469 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  32.58 
 
 
470 aa  200  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.57 
 
 
477 aa  190  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  29.6 
 
 
485 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  30.05 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  35.53 
 
 
485 aa  160  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 
811 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 
810 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
786 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  25.63 
 
 
797 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  25.82 
 
 
802 aa  55.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.45 
 
 
823 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  26.09 
 
 
815 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 
814 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 
820 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  29.08 
 
 
823 aa  54.7  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.15 
 
 
816 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  25.84 
 
 
856 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  28.4 
 
 
820 aa  54.3  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  22.83 
 
 
797 aa  54.3  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
815 aa  54.3  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  26.58 
 
 
798 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
815 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  28.74 
 
 
816 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  28.57 
 
 
823 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  25.1 
 
 
817 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  23.67 
 
 
932 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  28.8 
 
 
802 aa  52.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  28.74 
 
 
805 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  22.92 
 
 
783 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  25.71 
 
 
817 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 
771 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 
802 aa  50.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  22.92 
 
 
825 aa  50.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  24.84 
 
 
797 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 
804 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 
804 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  23.27 
 
 
788 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.7 
 
 
774 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  27.68 
 
 
816 aa  50.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  28.14 
 
 
809 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  28.86 
 
 
775 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  24.55 
 
 
807 aa  50.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  23.27 
 
 
788 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 
772 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  22.92 
 
 
775 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  23.58 
 
 
778 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
774 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 
823 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  28.14 
 
 
803 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  25.16 
 
 
793 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  27.43 
 
 
811 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
807 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  27.54 
 
 
806 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 
806 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 
816 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  29.34 
 
 
810 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  25.16 
 
 
801 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  24.29 
 
 
809 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  29.94 
 
 
806 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 
809 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  24.12 
 
 
804 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  26.79 
 
 
816 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  27.89 
 
 
682 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  25.16 
 
 
760 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 
809 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.15 
 
 
784 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  26.54 
 
 
776 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  25.67 
 
 
792 aa  48.5  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  25.27 
 
 
780 aa  48.5  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  26.54 
 
 
773 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.15 
 
 
784 aa  48.5  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 
804 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  26.54 
 
 
776 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>