70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2488 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  64.53 
 
 		 679 aa  924    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 678 aa  1399    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  62.3 
 
 		 694 aa  901    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  64.23 
 
 		 686 aa  908    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  64.64 
 
 		 676 aa  917    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  66.82 
 
 		 687 aa  945    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  47.99 
 
 		 676 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  47.09 
 
 		 678 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  44.77 
 
 		 676 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  44.98 
 
 		 679 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 684 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  50.39 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  50.52 
 
 		 689 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  38.53 
 
 		 682 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  38.01 
 
 		 682 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  37.06 
 
 		 681 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  48.65 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  37.83 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  37.3 
 
 		 681 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  49.9 
 
 		 703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  37.92 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  47.4 
 
 		 675 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  50.54 
 
 		 694 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  34.65 
 
 		 531 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  34.8 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  33.55 
 
 		 470 aa  233  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28.51 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  29.81 
 
 		 473 aa  197  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  28.25 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  26.27 
 
 		 485 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  27.74 
 
 		 186 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 826 aa  54.7  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  28.02 
 
 		 639 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  28.92 
 
 		 856 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 		 783 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  26.51 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  27.27 
 
 		 816 aa  48.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 783 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.11 
 
 		 786 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  27.71 
 
 		 783 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  26.99 
 
 		 785 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  25.62 
 
 		 805 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  26.67 
 
 		 785 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  27.98 
 
 		 785 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 812 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  27.98 
 
 		 785 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  27.11 
 
 		 783 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  26.99 
 
 		 785 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  27.11 
 
 		 800 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  27.38 
 
 		 779 aa  45.8  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 784 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 799 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  27.88 
 
 		 785 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  27.88 
 
 		 781 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 785 aa  45.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 802 aa  45.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  24.04 
 
 		 801 aa  44.7  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  25.86 
 
 		 932 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  26.43 
 
 		 804 aa  44.3  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  26.25 
 
 		 793 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  29.33 
 
 		 804 aa  43.9  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  24.16 
 
 		 788 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 		 817 aa  43.9  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  26.53 
 
 		 794 aa  43.9  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>