268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5032 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  87.85 
 
 		 676 aa  1254    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  60.85 
 
 		 687 aa  877    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 686 aa  1425    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  64.23 
 
 		 678 aa  908    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  69.85 
 
 		 694 aa  1004    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  74.93 
 
 		 679 aa  1095    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  44.64 
 
 		 676 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  44.05 
 
 		 678 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  42.69 
 
 		 676 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  41.7 
 
 		 684 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  42.73 
 
 		 679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  40.27 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  40.74 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  39.26 
 
 		 682 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  39.56 
 
 		 681 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  39.64 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  47.18 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  49.06 
 
 		 689 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  40.06 
 
 		 681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  46.88 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  45.47 
 
 		 703 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  47.44 
 
 		 675 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  45.61 
 
 		 694 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  33.33 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  31.73 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.6 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28.94 
 
 		 477 aa  211  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  29.87 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  28.16 
 
 		 485 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.37 
 
 		 485 aa  177  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 		 186 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 818 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  26.53 
 
 		 786 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.36 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  28.28 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  27.69 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  28.12 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  25.96 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 793 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  25.11 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  28.51 
 
 		 932 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.71 
 
 		 781 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  25.3 
 
 		 778 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  25.96 
 
 		 812 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 785 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  25.4 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  27.22 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  24.6 
 
 		 808 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  25.1 
 
 		 819 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 		 785 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  24.57 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  24.57 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.21 
 
 		 787 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 846 aa  62  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 800 aa  62  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  24.57 
 
 		 785 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 802 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  26.85 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 785 aa  61.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  28.26 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  25.6 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  28.26 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  25.6 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 776 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 773 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  25.4 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  28.26 
 
 		 776 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  26.06 
 
 		 800 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  26.32 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  25.71 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 		 801 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  25.94 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  25 
 
 		 802 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  25.47 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  26.58 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  26.38 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  24.4 
 
 		 826 aa  58.9  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  30.12 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  26.32 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25.66 
 
 		 812 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  26.51 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  24.51 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>