32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0793 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  100 
 
 
485 aa  1005    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  47.74 
 
 
485 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  43.13 
 
 
473 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  29.92 
 
 
469 aa  207  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  53.41 
 
 
186 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  29.2 
 
 
676 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  28.85 
 
 
679 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  28.16 
 
 
686 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  27.43 
 
 
694 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  33.33 
 
 
477 aa  180  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  29.23 
 
 
676 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  29.29 
 
 
675 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  27.31 
 
 
676 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  30.08 
 
 
531 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  31.51 
 
 
470 aa  169  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  27.23 
 
 
694 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  27.05 
 
 
703 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  28.91 
 
 
689 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  28.88 
 
 
681 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  29.6 
 
 
682 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  28.01 
 
 
682 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  29.02 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  26.27 
 
 
678 aa  163  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  27.77 
 
 
686 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  26.63 
 
 
682 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  27.42 
 
 
678 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  26.33 
 
 
687 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  27.39 
 
 
684 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  27.03 
 
 
670 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  27.16 
 
 
679 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  25.11 
 
 
684 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  25.49 
 
 
681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>