More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1126 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  65.38 
 
 		 676 aa  936    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  50.45 
 
 		 676 aa  689    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  47.09 
 
 		 678 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  45.19 
 
 		 679 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  45.21 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  44.28 
 
 		 694 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  44.05 
 
 		 686 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 687 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  42.06 
 
 		 679 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 684 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.2 
 
 		 681 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  37.22 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  37.22 
 
 		 684 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37.79 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  36.54 
 
 		 682 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  35.74 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  45.86 
 
 		 689 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  43.78 
 
 		 686 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  43.04 
 
 		 670 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  44.21 
 
 		 703 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  44.11 
 
 		 694 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  41.12 
 
 		 675 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  31.02 
 
 		 508 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  30.13 
 
 		 531 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  30.17 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  29.74 
 
 		 470 aa  183  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  28.78 
 
 		 473 aa  173  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  26.14 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.42 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 186 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.74 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.86 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  26.74 
 
 		 804 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  29.03 
 
 		 802 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  25.32 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 825 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.37 
 
 		 784 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  29.58 
 
 		 799 aa  62  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  27.46 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  27.46 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  27.22 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.86 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  28.39 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  30.43 
 
 		 798 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.37 
 
 		 784 aa  60.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  27.21 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  30.2 
 
 		 802 aa  60.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  28.39 
 
 		 785 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  28.78 
 
 		 816 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  28.67 
 
 		 783 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  28.39 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  27.21 
 
 		 803 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  25.16 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  29.55 
 
 		 812 aa  59.7  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  26.45 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  26.76 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  27.78 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 802 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  27.65 
 
 		 783 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  25.97 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  28.39 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  26.45 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  28.39 
 
 		 785 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  25.16 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  24.86 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 796 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  25.87 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  28.57 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  29.37 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>