33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1245 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  68.64 
 
 		 508 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  100 
 
 		 531 aa  1051    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  39.57 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  34.65 
 
 		 678 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  36.21 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  33.55 
 
 		 679 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  34.37 
 
 		 687 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  36.09 
 
 		 469 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  33.33 
 
 		 686 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  34.44 
 
 		 676 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  31.93 
 
 		 694 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  33.76 
 
 		 684 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  34.28 
 
 		 682 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  34.71 
 
 		 682 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  34.78 
 
 		 676 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  33.77 
 
 		 684 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  34.2 
 
 		 681 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  32.62 
 
 		 679 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  32.89 
 
 		 670 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  31.72 
 
 		 689 aa  236  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  31.65 
 
 		 686 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  33.26 
 
 		 682 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  32.61 
 
 		 681 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  33.26 
 
 		 675 aa  230  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  32.47 
 
 		 676 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  31.8 
 
 		 694 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  30.07 
 
 		 703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  30.13 
 
 		 678 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  32.78 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 485 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  30.08 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  50 
 
 		 1838 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 186 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>