More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_258 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  50.52 
 
 		 676 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  50.45 
 
 		 678 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 676 aa  1389    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  44.77 
 
 		 678 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  43.75 
 
 		 694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  44.05 
 
 		 679 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 		 687 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  44.63 
 
 		 676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  42.69 
 
 		 686 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  41.62 
 
 		 679 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  40.3 
 
 		 684 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  38.12 
 
 		 681 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  38.11 
 
 		 682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37.55 
 
 		 682 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  36.42 
 
 		 681 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  36.84 
 
 		 684 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  44.51 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  37.01 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  44.47 
 
 		 689 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  45.32 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  43.71 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  44.66 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  43.15 
 
 		 675 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  36.14 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  32.47 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  33.19 
 
 		 470 aa  210  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.28 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  29.64 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.85 
 
 		 477 aa  198  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.31 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 798 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.81 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  29.59 
 
 		 186 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  27.16 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.45 
 
 		 828 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  28.12 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  27.61 
 
 		 783 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  25.31 
 
 		 818 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  24.26 
 
 		 813 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  24.07 
 
 		 826 aa  65.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 813 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  28.48 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  25.31 
 
 		 802 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  25.77 
 
 		 823 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  26.45 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 		 802 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  26.35 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  27.1 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  26.99 
 
 		 783 aa  65.1  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  26.88 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  26.35 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 797 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 808 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.38 
 
 		 784 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  24.69 
 
 		 812 aa  63.9  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  26.38 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  27.38 
 
 		 805 aa  63.9  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  29.05 
 
 		 820 aa  63.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 821 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 		 812 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.38 
 
 		 784 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  24.68 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 807 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  25.5 
 
 		 812 aa  63.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  25.95 
 
 		 805 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  25.79 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  24.83 
 
 		 806 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  26.45 
 
 		 825 aa  63.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>