More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1204 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  100 
 
 
305 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  67 
 
 
304 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  68.53 
 
 
324 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  62.5 
 
 
307 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  48.49 
 
 
313 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  50.9 
 
 
312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  47.23 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  51.09 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  51.09 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  51.09 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  49.15 
 
 
313 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  50.72 
 
 
313 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  47.04 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  50.72 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  50.72 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  48.16 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  48.16 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  48.16 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  48.16 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  50 
 
 
313 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  45.81 
 
 
317 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  48.14 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  47.87 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  46.56 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  46.85 
 
 
314 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  47.54 
 
 
319 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  45.03 
 
 
323 aa  268  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  47.02 
 
 
305 aa  268  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  47.21 
 
 
319 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  45.8 
 
 
314 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  44.74 
 
 
318 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  44.41 
 
 
318 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  47.87 
 
 
319 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  46.91 
 
 
329 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  43.18 
 
 
312 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  44.76 
 
 
311 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  45.8 
 
 
314 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  47.1 
 
 
320 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  47.29 
 
 
310 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  47.67 
 
 
341 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  47.33 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  43.48 
 
 
299 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  45.65 
 
 
277 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  47.81 
 
 
280 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  47.83 
 
 
281 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  42.47 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  44.85 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  44.04 
 
 
334 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  47.46 
 
 
279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  42.35 
 
 
315 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  41.86 
 
 
319 aa  235  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  41.11 
 
 
287 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  41.96 
 
 
288 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  42.54 
 
 
323 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  40.14 
 
 
283 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  225  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  39.25 
 
 
296 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  39.72 
 
 
296 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  39.79 
 
 
296 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  39.93 
 
 
284 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  41.28 
 
 
277 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  37.54 
 
 
291 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  37.59 
 
 
284 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  39.86 
 
 
276 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  38.6 
 
 
283 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  36.65 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  35.59 
 
 
292 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  34.52 
 
 
278 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  39.27 
 
 
271 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  36.95 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  37.68 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  37.32 
 
 
281 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  37.58 
 
 
292 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  34.88 
 
 
280 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  37.86 
 
 
283 aa  185  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.3 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  36.17 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  36.82 
 
 
294 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  36.82 
 
 
294 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  38.08 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  38.87 
 
 
270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  35.11 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  33.45 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  34.28 
 
 
279 aa  165  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.72 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  33.68 
 
 
290 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  33.1 
 
 
281 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  33.1 
 
 
281 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.65 
 
 
274 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  29.47 
 
 
315 aa  150  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.19 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  30.88 
 
 
316 aa  143  3e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  32.41 
 
 
281 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  31.27 
 
 
271 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>