More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1269 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1186  ribonuclease  96.04 
 
 		 454 aa  874    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1269  ribonuclease  100 
 
 		 459 aa  914    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  43.3 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1450  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.82 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0135  ribonuclease  42.29 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  35.56 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  36.78 
 
 		 562 aa  265  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  38.5 
 
 		 702 aa  264  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  41.41 
 
 		 1427 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 		 571 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  41.35 
 
 		 1194 aa  260  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  39.41 
 
 		 908 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  36.22 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  33.56 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  35.03 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  39.17 
 
 		 1024 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  38.93 
 
 		 1058 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  39.3 
 
 		 1048 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  32.68 
 
 		 483 aa  252  9.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  34.93 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  34.88 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  31.06 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  39.51 
 
 		 990 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  36.82 
 
 		 1022 aa  249  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  39.15 
 
 		 1007 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  37.26 
 
 		 1080 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  39.07 
 
 		 1093 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  38.4 
 
 		 1040 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  38.69 
 
 		 922 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  39.15 
 
 		 717 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  38.18 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  35.91 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  38.12 
 
 		 1093 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  36.47 
 
 		 559 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  35.78 
 
 		 497 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  32.45 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  34.48 
 
 		 1113 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  32.3 
 
 		 537 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  39.37 
 
 		 953 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  35.79 
 
 		 713 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  38.23 
 
 		 1334 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  36.07 
 
 		 564 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  37.44 
 
 		 1151 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 		 1041 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  33.33 
 
 		 512 aa  242  9e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  35.28 
 
 		 687 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  40.3 
 
 		 1018 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  35.38 
 
 		 490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  32.73 
 
 		 497 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  32.73 
 
 		 497 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  38.5 
 
 		 1070 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  38.44 
 
 		 987 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  37.62 
 
 		 974 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  38.44 
 
 		 991 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  38.44 
 
 		 991 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  36.79 
 
 		 1117 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  38.9 
 
 		 1043 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  33.55 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  33.12 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  36.67 
 
 		 1123 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  35.8 
 
 		 411 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  37.41 
 
 		 944 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.51 
 
 		 489 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  34.87 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  34.76 
 
 		 489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  37.99 
 
 		 961 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  38.6 
 
 		 1244 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  36.96 
 
 		 1091 aa  236  7e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  34.34 
 
 		 489 aa  236  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  35.46 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  31.92 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  36.93 
 
 		 1265 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  34.49 
 
 		 647 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  34.42 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  31.47 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  30.85 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 645 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  35.98 
 
 		 485 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  36.68 
 
 		 492 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  36.08 
 
 		 487 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  37.77 
 
 		 1016 aa  232  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  37.14 
 
 		 952 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  34.79 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  35.34 
 
 		 488 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  35.98 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  33.66 
 
 		 602 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  34.01 
 
 		 682 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  31.03 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  36.92 
 
 		 485 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  32.81 
 
 		 535 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  34.62 
 
 		 606 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  35.25 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  36.68 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  36.68 
 
 		 485 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  36.68 
 
 		 485 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  35.05 
 
 		 646 aa  229  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  32.76 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  34.28 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  33.4 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  35.13 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>