More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1548 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1548  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 726 aa  1492    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  22.58 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1138  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 652 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 627 aa  73.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.69 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  29.64 
 
 		 702 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  28.77 
 
 		 704 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.45 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  21.8 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  23.12 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  29.55 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 720 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  28.77 
 
 		 704 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  25 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.03 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 843 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  30.68 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 715 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 828 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  23.45 
 
 		 675 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  31.18 
 
 		 839 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 637 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 679 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 688 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 613 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 966 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 767 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23 
 
 		 653 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27.7 
 
 		 759 aa  55.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 632 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 732 aa  55.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  22.7 
 
 		 623 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.95 
 
 		 631 aa  55.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 611 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  21.95 
 
 		 739 aa  55.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 647 aa  54.7  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 971 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  20.85 
 
 		 683 aa  54.7  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  20.33 
 
 		 648 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1128 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 614 aa  54.3  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 681 aa  54.3  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  44.29 
 
 		 843 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 707 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 641 aa  53.9  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 638 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 694 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.83 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  23.55 
 
 		 742 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 634 aa  53.9  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 791 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 789 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 842 aa  53.9  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 702 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  32.98 
 
 		 833 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 665 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  28.83 
 
 		 724 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 710 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  29.41 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  32.99 
 
 		 777 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 634 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 869 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 702 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 790 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  28.83 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 728 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  28.83 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.83 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 728 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.03 
 
 		 848 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  28.83 
 
 		 724 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 710 aa  52  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 794 aa  52  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 647 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.16 
 
 		 687 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 726 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 699 aa  51.6  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 634 aa  51.6  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 634 aa  51.6  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 836 aa  51.2  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 904 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 853 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 904 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>