More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1120 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2782  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  99.77 
 
 
433 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1120  HlyD family protein secretion protein , membrane fusion protein  100 
 
 
433 aa  838    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.1 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.49 
 
 
473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.04 
 
 
481 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.4 
 
 
438 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  30.73 
 
 
436 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.37 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.89 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.56 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.46 
 
 
492 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.11 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  30.54 
 
 
661 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.57 
 
 
437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.66 
 
 
437 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.28 
 
 
441 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  28.37 
 
 
441 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.93 
 
 
494 aa  157  4e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.12 
 
 
432 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
441 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.36 
 
 
446 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  29.27 
 
 
446 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.5 
 
 
454 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.72 
 
 
455 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.28 
 
 
447 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.84 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.07 
 
 
448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.07 
 
 
448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  30.47 
 
 
469 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.31 
 
 
479 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28 
 
 
431 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  30.23 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.22 
 
 
455 aa  146  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.38 
 
 
477 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.21 
 
 
456 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.68 
 
 
448 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.15 
 
 
451 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.77 
 
 
462 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.2 
 
 
460 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  29.38 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.38 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.79 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  29.75 
 
 
446 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  27.1 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  29.77 
 
 
446 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.02 
 
 
440 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.48 
 
 
435 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.61 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.14 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.34 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.77 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.8 
 
 
449 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.23 
 
 
453 aa  136  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.8 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.12 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.08 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.89 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.44 
 
 
440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.44 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.51 
 
 
420 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.65 
 
 
433 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.96 
 
 
460 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
444 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.38 
 
 
442 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  28.84 
 
 
349 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.7 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.73 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.33 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.12 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.68 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.82 
 
 
438 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.75 
 
 
460 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.06 
 
 
435 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.15 
 
 
453 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.12 
 
 
460 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
505 aa  130  6e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  29.95 
 
 
447 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.76 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  27.41 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.68 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  27.17 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.4 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.02 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.11 
 
 
440 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.14 
 
 
395 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  27.99 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.92 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.19 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  24.71 
 
 
488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.92 
 
 
443 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  27.92 
 
 
432 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.02 
 
 
417 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  27.89 
 
 
435 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.9 
 
 
448 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.42 
 
 
448 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  27.29 
 
 
462 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 
393 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.02 
 
 
446 aa  123  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.84 
 
 
436 aa  123  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.77 
 
 
408 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>