164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_11221 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_11221  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.587962  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0424  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  98.25 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.609704  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12471  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.94 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15231  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  39.73 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.303288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07411  NAD-dependent DNA ligase  38.57 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07431  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.57 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000724415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0694  NAD-dependent DNA ligase  37.67 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15631  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  35.06 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15481  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  36.52 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0413  NAD-dependent DNA ligase  29.8 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11091  hypothetical protein  29.8 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.5 
 
 		 669 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  29.03 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  23.76 
 
 		 684 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  27.57 
 
 		 690 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.84 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  27.96 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.42 
 
 		 669 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  26.7 
 
 		 674 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.42 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.67 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  27.18 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  25.49 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.73 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  23.89 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000122507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  25 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.12 
 
 		 676 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  25.5 
 
 		 690 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.44 
 
 		 697 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  24.14 
 
 		 678 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  21.54 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  26.87 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  25.5 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  24.38 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  26.75 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.5 
 
 		 673 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 663 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  25.98 
 
 		 715 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  22.22 
 
 		 680 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1672  DNA ligase, NAD-dependent  25.71 
 
 		 740 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.672303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.26 
 
 		 669 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  22.33 
 
 		 696 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  23.11 
 
 		 681 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  25.96 
 
 		 670 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2083  DNA ligase, NAD-dependent  25.71 
 
 		 731 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0521924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.5 
 
 		 670 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  23.5 
 
 		 670 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03590  NAD-dependent DNA ligase LigB  30.23 
 
 		 560 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1699  DNA ligase (NAD+)  24.39 
 
 		 677 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.699894  normal  0.700726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  23.43 
 
 		 703 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 690 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  24.49 
 
 		 662 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  25.74 
 
 		 673 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  23.67 
 
 		 684 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  23.79 
 
 		 678 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  23.74 
 
 		 667 aa  52.4  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  27.23 
 
 		 665 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.38 
 
 		 670 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.15 
 
 		 680 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  24.3 
 
 		 732 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  22.97 
 
 		 672 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  22.67 
 
 		 670 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.14 
 
 		 738 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  24.24 
 
 		 688 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  25.12 
 
 		 669 aa  51.6  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  24.24 
 
 		 688 aa  52  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  25.51 
 
 		 668 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  25.89 
 
 		 714 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1398  DNA ligase, NAD-dependent  24.37 
 
 		 739 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.695979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 690 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  24.24 
 
 		 680 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  25.25 
 
 		 691 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  25.37 
 
 		 673 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  25.42 
 
 		 712 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.86 
 
 		 717 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  25.98 
 
 		 714 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  24.38 
 
 		 704 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4355  DNA ligase, NAD-dependent  22.6 
 
 		 701 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0664546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  23.83 
 
 		 681 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  24.69 
 
 		 677 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.48 
 
 		 718 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.48 
 
 		 718 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  23.15 
 
 		 668 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  25.11 
 
 		 672 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 776 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  18.5 
 
 		 664 aa  48.5  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.62 
 
 		 787 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.38 
 
 		 786 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 776 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  23.88 
 
 		 662 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  24.5 
 
 		 672 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  26.11 
 
 		 675 aa  48.1  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>