More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4355 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4355  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 
701 aa  1431    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0664546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3569  DNA ligase (NAD(+))  39.63 
 
 
696 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  34.64 
 
 
662 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  36.55 
 
 
708 aa  347  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  34.48 
 
 
663 aa  336  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  35.2 
 
 
695 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.6 
 
 
676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  32.88 
 
 
681 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  33.59 
 
 
688 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  33.59 
 
 
688 aa  325  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.34 
 
 
691 aa  324  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  33.05 
 
 
705 aa  323  7e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  33.64 
 
 
663 aa  322  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  32.4 
 
 
678 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.04 
 
 
679 aa  321  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  35.04 
 
 
691 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.72 
 
 
670 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.23 
 
 
712 aa  320  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.8 
 
 
701 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.8 
 
 
701 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.8 
 
 
701 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  33.04 
 
 
684 aa  319  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  34.07 
 
 
708 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  34.22 
 
 
726 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  34.32 
 
 
673 aa  318  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.71 
 
 
670 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  34.8 
 
 
703 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.14 
 
 
707 aa  317  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  33.14 
 
 
681 aa  316  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  33.38 
 
 
670 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.72 
 
 
671 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  35.79 
 
 
696 aa  315  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.72 
 
 
671 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  32.38 
 
 
665 aa  315  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.77 
 
 
671 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.62 
 
 
671 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  34.42 
 
 
691 aa  313  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  32.63 
 
 
669 aa  312  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.48 
 
 
671 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  33.43 
 
 
671 aa  312  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  31.39 
 
 
685 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  32.63 
 
 
672 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  33.43 
 
 
671 aa  312  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  34.23 
 
 
664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  32.83 
 
 
674 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.19 
 
 
671 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.19 
 
 
671 aa  310  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  33.19 
 
 
671 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  32.9 
 
 
707 aa  310  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  33.19 
 
 
671 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.19 
 
 
671 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  32.84 
 
 
673 aa  310  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  33.09 
 
 
689 aa  309  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  34.71 
 
 
691 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  35.15 
 
 
688 aa  309  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.04 
 
 
671 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  33.09 
 
 
691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.04 
 
 
671 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.04 
 
 
671 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  33.23 
 
 
659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  32.47 
 
 
691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  32.79 
 
 
690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  34.41 
 
 
673 aa  308  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  32.53 
 
 
674 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  34.16 
 
 
790 aa  308  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  32.79 
 
 
690 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  32.86 
 
 
722 aa  306  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.43 
 
 
671 aa  306  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  34.24 
 
 
670 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  33.19 
 
 
678 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  33.97 
 
 
691 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  33.08 
 
 
670 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  33.97 
 
 
691 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  33.09 
 
 
673 aa  304  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  34.44 
 
 
770 aa  304  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  31.69 
 
 
667 aa  303  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  31.69 
 
 
667 aa  303  7.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  33.91 
 
 
670 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  34.96 
 
 
686 aa  303  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  32.75 
 
 
685 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  34.55 
 
 
688 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  32.55 
 
 
685 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  34.45 
 
 
752 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  33.67 
 
 
691 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  32.85 
 
 
671 aa  301  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  34.68 
 
 
711 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  32.94 
 
 
718 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  34.6 
 
 
686 aa  301  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  34.96 
 
 
693 aa  301  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  34.11 
 
 
688 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  34.26 
 
 
671 aa  300  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  34.68 
 
 
699 aa  300  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  33.09 
 
 
683 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  32.4 
 
 
690 aa  300  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>