More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3569 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3569  DNA ligase (NAD(+))  100 
 
 		 696 aa  1395    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.96 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  38.7 
 
 		 689 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  37.86 
 
 		 673 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  38.55 
 
 		 690 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  38.55 
 
 		 691 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  40.29 
 
 		 675 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  38.4 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  37.57 
 
 		 670 aa  416  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  35.26 
 
 		 669 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  38.26 
 
 		 672 aa  412  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.54 
 
 		 670 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  36.83 
 
 		 672 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  36.1 
 
 		 673 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  37.72 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  38.03 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4355  DNA ligase, NAD-dependent  39.37 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0664546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  34.12 
 
 		 662 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  39.68 
 
 		 673 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  36.94 
 
 		 675 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.37 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.22 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.46 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.46 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.46 
 
 		 669 aa  399  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.31 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  36.83 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.46 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.16 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  39.83 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  36.47 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  36.12 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.63 
 
 		 670 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.01 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  36.12 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  36.9 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.01 
 
 		 669 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  38.15 
 
 		 681 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.11 
 
 		 669 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  36.9 
 
 		 685 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.34 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  36.61 
 
 		 685 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  36.65 
 
 		 670 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.34 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 697 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  38.05 
 
 		 681 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  37.08 
 
 		 670 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  35.23 
 
 		 665 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  36.74 
 
 		 691 aa  388  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  36.97 
 
 		 691 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.03 
 
 		 711 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  35.91 
 
 		 670 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  36.73 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  37.68 
 
 		 688 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  36.15 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  37.54 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  34.12 
 
 		 668 aa  385  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  36.09 
 
 		 662 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 683 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  38.29 
 
 		 703 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  36.93 
 
 		 673 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  37.07 
 
 		 722 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  35.78 
 
 		 673 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  36.16 
 
 		 673 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  38.27 
 
 		 673 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  37.5 
 
 		 674 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  38.39 
 
 		 695 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  35.27 
 
 		 688 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  38.64 
 
 		 683 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.63 
 
 		 681 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  36.67 
 
 		 671 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  34.34 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  36.32 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  37.32 
 
 		 691 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  37.64 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  36.67 
 
 		 671 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.32 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0673  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.58 
 
 		 651 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  35.27 
 
 		 688 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  37.82 
 
 		 700 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.59 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.67 
 
 		 670 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  36.99 
 
 		 671 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  35.9 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.32 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.32 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  38.3 
 
 		 678 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  36.68 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.44 
 
 		 673 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  36.78 
 
 		 690 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  36.87 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  36.18 
 
 		 670 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>