More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12471 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12471  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07431  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  61.85 
 
 
249 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000724415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07411  NAD-dependent DNA ligase  62.25 
 
 
249 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0694  NAD-dependent DNA ligase  61.45 
 
 
249 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15231  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  51 
 
 
249 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.303288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15481  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  47.79 
 
 
249 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15631  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  46.99 
 
 
249 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11221  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.94 
 
 
228 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.587962  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0424  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  38.5 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.609704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0413  NAD-dependent DNA ligase  30.15 
 
 
210 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11091  hypothetical protein  31.68 
 
 
200 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  28.33 
 
 
668 aa  95.5  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  29.09 
 
 
665 aa  86.3  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000122507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  27.87 
 
 
681 aa  86.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  25.89 
 
 
686 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  26.56 
 
 
672 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0981  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.49 
 
 
666 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  27.85 
 
 
670 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  27.46 
 
 
664 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  26.54 
 
 
673 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.67 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  26.16 
 
 
684 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.62 
 
 
774 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  27.06 
 
 
688 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  27.06 
 
 
688 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  26.23 
 
 
673 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  27.12 
 
 
673 aa  75.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  28.04 
 
 
690 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.65 
 
 
669 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  28.77 
 
 
674 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.23 
 
 
669 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  28.17 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  29.58 
 
 
684 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.88 
 
 
679 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.29 
 
 
670 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.1 
 
 
669 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  28.32 
 
 
664 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.17 
 
 
787 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  26.85 
 
 
673 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  28.97 
 
 
690 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  27.96 
 
 
663 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  24.42 
 
 
659 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.1 
 
 
669 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  27.27 
 
 
695 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.1 
 
 
669 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  28.71 
 
 
696 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.1 
 
 
669 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  28.43 
 
 
667 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.62 
 
 
669 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.62 
 
 
669 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.62 
 
 
669 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.62 
 
 
669 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  33.17 
 
 
666 aa  72  0.000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.89 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  26.25 
 
 
670 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  28.2 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  27.12 
 
 
670 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.83 
 
 
670 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  24.14 
 
 
718 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  28.04 
 
 
674 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4126  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.97 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  29.27 
 
 
669 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.14 
 
 
669 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  28.71 
 
 
678 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  31.25 
 
 
668 aa  70.5  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4019  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.57 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3956  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.29 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4065  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.29 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  25.8 
 
 
674 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  25.41 
 
 
716 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  31.37 
 
 
669 aa  68.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.13 
 
 
776 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  24.84 
 
 
673 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5270  NAD-dependent DNA ligase LigB  24.39 
 
 
558 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.27312  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  24.9 
 
 
561 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  27.38 
 
 
697 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  25.48 
 
 
715 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  29.61 
 
 
722 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  30.35 
 
 
684 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  24.34 
 
 
725 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3689  Fis family transcriptional regulator  30.29 
 
 
768 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.98 
 
 
697 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.81 
 
 
776 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4796  NAD-dependent DNA ligase LigB  25 
 
 
561 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  23.2 
 
 
691 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  25.22 
 
 
708 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  25.39 
 
 
726 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  25.9 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  24.92 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.7 
 
 
786 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  25.24 
 
 
681 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.7 
 
 
696 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  27.36 
 
 
680 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  25 
 
 
695 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  24.67 
 
 
677 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1480  DNA ligase, NAD-dependent  33.68 
 
 
663 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  24.54 
 
 
566 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  26.4 
 
 
661 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  24.27 
 
 
672 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  25.65 
 
 
708 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>