234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15481 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15481  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15631  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  95.58 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15231  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  69.08 
 
 		 249 aa  359  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.303288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07431  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  49.4 
 
 		 249 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000724415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07411  NAD-dependent DNA ligase  49.4 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0694  NAD-dependent DNA ligase  48.33 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12471  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  47.79 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11221  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  36.52 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.587962  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0424  NAD-dependent DNA ligase N-terminus  36.52 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.609704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11091  hypothetical protein  28.28 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0413  NAD-dependent DNA ligase  27.78 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf373  DNA ligase  28.28 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000122507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0453  NAD-dependent DNA ligase LigB  22.92 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  26.37 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  27.5 
 
 		 688 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  27.5 
 
 		 688 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03590  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.62 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  25.17 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  27.05 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  24.59 
 
 		 691 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  26.23 
 
 		 691 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  24.87 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3956  NAD-dependent DNA ligase LigB  26.7 
 
 		 561 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5270  NAD-dependent DNA ligase LigB  22 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.27312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4065  NAD-dependent DNA ligase LigB  26.7 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3981  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.67 
 
 		 560 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4019  NAD-dependent DNA ligase LigB  26.7 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  26.7 
 
 		 561 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  23 
 
 		 684 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  29.02 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0498  NAD-dependent DNA ligase LigB  19.76 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4126  NAD-dependent DNA ligase LigB  26.14 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  30.39 
 
 		 670 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4968  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.6 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 690 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3947  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.55 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0562  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.28 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0449275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  24.75 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  21.61 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4841  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.2 
 
 		 566 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  25.5 
 
 		 681 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0092  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.79 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  26.97 
 
 		 666 aa  58.9  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  26.83 
 
 		 668 aa  58.5  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0382  DNA ligase, NAD-dependent, putative  23.59 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03504  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.46 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0058  DNA ligase (NAD(+))  23.46 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0064  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.46 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199825  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4148  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.87 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.969555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  21.91 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03456  hypothetical protein  23.46 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5017  NAD-dependent DNA ligase LigB  23.98 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1518  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.57 
 
 		 629 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000466124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  25.13 
 
 		 674 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3858  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.25 
 
 		 562 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  24.57 
 
 		 662 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  25.82 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  26.34 
 
 		 708 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.87 
 
 		 697 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  22.64 
 
 		 670 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  25.56 
 
 		 670 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  26.38 
 
 		 662 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.46 
 
 		 669 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4796  NAD-dependent DNA ligase LigB  25.64 
 
 		 561 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0176642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  29.19 
 
 		 656 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.53 
 
 		 679 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.46 
 
 		 669 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0757  DNA ligase, NAD-dependent  25.43 
 
 		 682 aa  55.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320079  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  25 
 
 		 705 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  23.65 
 
 		 712 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  25.42 
 
 		 662 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.5 
 
 		 680 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  22.66 
 
 		 672 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  22.65 
 
 		 726 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  24.23 
 
 		 718 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.46 
 
 		 669 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.68 
 
 		 787 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4144  NAD-dependent DNA ligase LigB  27.33 
 
 		 560 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.610084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.46 
 
 		 669 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  24.38 
 
 		 678 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  26.49 
 
 		 672 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  25.41 
 
 		 664 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.5 
 
 		 680 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.46 
 
 		 669 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  24.6 
 
 		 674 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6162  DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+))  23.48 
 
 		 716 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.44 
 
 		 670 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.26 
 
 		 776 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  24.1 
 
 		 669 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  23.56 
 
 		 677 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0136  DNA ligase, NAD-dependent  28.96 
 
 		 673 aa  52.8  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.145225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  23.68 
 
 		 787 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  25.14 
 
 		 667 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  25.35 
 
 		 676 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  25.14 
 
 		 667 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  23.91 
 
 		 669 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  23.68 
 
 		 684 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  24.48 
 
 		 664 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4355  DNA ligase, NAD-dependent  22.89 
 
 		 701 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0664546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  26.78 
 
 		 704 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>