More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10980 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
268 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  66.54 
 
 
281 aa  351  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  65.56 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  58.21 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  55.79 
 
 
274 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  58.37 
 
 
272 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  54.86 
 
 
263 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  55.08 
 
 
262 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  54.69 
 
 
262 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  54.69 
 
 
262 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  54.3 
 
 
262 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  55.97 
 
 
278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  51.16 
 
 
275 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  53.12 
 
 
262 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  53.5 
 
 
261 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50.42 
 
 
289 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  54.27 
 
 
277 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  56.39 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  50.77 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  52.33 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  51.67 
 
 
273 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  52.12 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  52.87 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  51.34 
 
 
267 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  55.89 
 
 
269 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  51.28 
 
 
274 aa  228  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  50.97 
 
 
267 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  51.98 
 
 
302 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  50.2 
 
 
264 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  51.19 
 
 
272 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  53.7 
 
 
306 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  49.44 
 
 
270 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  54.98 
 
 
265 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  52.07 
 
 
273 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.04 
 
 
261 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  49.22 
 
 
260 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 
272 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  52.89 
 
 
292 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.48 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 
266 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.96 
 
 
256 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  41.15 
 
 
302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 
254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
278 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 
266 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  35.92 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  37.96 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 
259 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  32.79 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  32.17 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  33.86 
 
 
262 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 
263 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.15 
 
 
274 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  41.25 
 
 
267 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.56 
 
 
264 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  31.4 
 
 
280 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 
280 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.08 
 
 
255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.69 
 
 
265 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 
271 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 
269 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 
258 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 
266 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 
290 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 
259 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  41.6 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  33.87 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 
271 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 
253 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  37.71 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 
267 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  34.25 
 
 
700 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.53 
 
 
268 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 
259 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  35.59 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 
263 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  31.93 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  38.85 
 
 
290 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  31.28 
 
 
257 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  34.18 
 
 
255 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 
266 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  34.73 
 
 
271 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  33.61 
 
 
257 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  39.32 
 
 
275 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 
267 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  37.97 
 
 
296 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 
270 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  41.46 
 
 
273 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  31.08 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>