More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1933 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  77.53 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  64.75 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  65.04 
 
 		 273 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  63.88 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  65.25 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  59.77 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  60.08 
 
 		 261 aa  291  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  64.26 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  63.94 
 
 		 274 aa  288  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  64.59 
 
 		 266 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  62.35 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  57.41 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  58.75 
 
 		 262 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 		 262 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  64.94 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  57.43 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  60.68 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  58.09 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  62.4 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50.18 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  58.17 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  65.1 
 
 		 269 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  62.15 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  67.42 
 
 		 265 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  61.33 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  60.53 
 
 		 270 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  60.67 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  54.22 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 272 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  51.6 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.91 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  41 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  43.61 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  40.46 
 
 		 700 aa  189  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.1 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 271 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.6 
 
 		 260 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.75 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  41.84 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 259 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.97 
 
 		 262 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  43.49 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  38.67 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  42.65 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  46.38 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  46.22 
 
 		 274 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  43.39 
 
 		 271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>