More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2941 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  80.99 
 
 		 263 aa  427  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  69.81 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  62.5 
 
 		 269 aa  321  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  59.32 
 
 		 267 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  60.37 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  62.65 
 
 		 266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  55.68 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  59.32 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  62.26 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  55.51 
 
 		 261 aa  278  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  61.65 
 
 		 273 aa  275  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  60.89 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  61.42 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  57.95 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  53.44 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  60.15 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  58.89 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  58.55 
 
 		 277 aa  264  8.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  53.41 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  52.27 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  52.65 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  59.09 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  50.63 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  52.34 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  53.42 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  55.51 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  51.95 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  52.09 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  55.34 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  47.52 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  48.94 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.18 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 279 aa  191  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.62 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.31 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  39.69 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  39.34 
 
 		 276 aa  175  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  44.07 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  39.5 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.83 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.4 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.34 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  39.62 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.4 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.37 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  38.64 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.52 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  43.36 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.82 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.66 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  36.84 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  38.13 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.4 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 268 aa  165  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  35.23 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>